lo que comentas de trazo limpio, es cuando haces el trazo, el AZPAINTER, obliga al brush a no "dibujar" mas pixels alrededor de lo trazado.
en la captura que te puse yo, se genera lo que se llamaria ACOPLE. eso es algo inevitable al menos en los programas estos.
tanto el photoshop, corel, paintshop pro, manga studio y sai, eso, ocurre.
el algoritmo del AZPAINTER debe tener mucha mas precision a la hora de hacer el trazo como lo detallas.
y lamentablemente, al usar el mangastudio y que te ocurra el acople de pixels, uno despues tiene que "limpiar" esos pixels.
esta imagen esta hecha con el SAI

y la misma, dandole zoom, podras ver que tiene muchos pixel acoplados.

aqui tambien puedes ver pixels acoplados.
esta en uno hacer la limpieza de los mismos. o en todo caso, ver de usar el AZPAINTER por su algoritmo de brush
ah, tambien te queria decir. en la imagen de captura que puse antes, fijate que hay uno que dice DOT PEN. ese ya viene predeterminado como 1 PIXEL BRUSH
saludos